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审计是动态的、循环的，完整的知识审计过程，一般来说包括三个阶段。
1.准备阶段
这个阶段要定义知识审计的目标、识别各种限制条件、制定知识审计的计划、确定知识审计的指标体系。定义审计目标，是为了规范审计的目的、审计的对象和范围，所以目标要尽可能的具体;识别限制条件和制定计划，是为了在知识审计的实施过程中，能有的放矢，并把成本控制在预算之内。限制条件，包括了财务预算上的限制、组织内部基础设施的限制、时间限制等;确定知识审计的指标体系是为知识审计提供比较的基准，前提是要对理想的状态有清楚的认识。
2.实施阶段
这个阶段，在准备阶段所做工作的基础上，要依据组织的具体情况，选择知识审计方法，实施知识审计。知识审计的实施阶段包括了数据的收集和分析。
3.完成阶段
在这个阶段，要整理和评价知识审计完成后得到的数据，形成审计的意见和建议，编写知识审计报告。一般来讲，需要绘制知识地图，描述组织的知识流，找出组织的知识差距。
