会计师事务所主要是为企业提供审计服务，其出具的审计报告是投资人进行投资决策的依据。由于目前我国审计法规尚未健全，监管不够规范，使审计工作的独立性受到质疑。
　　1、影响审计独立性的因素是：
　　审计关系是指基于受托责任而形成的。审计存在着委托人，被审计人与审计人三者之间的特殊关系。委托人是财产拥有者，被审计人是受托管理财产的代理人，二者与审计人共同构成审计关系的三个主体。我国大部分上市公司由于是从国有企业改制而来的，导致法人治理结构存在着诸多问题，国有股份占绝对控股地位的现实造成了所有者终极代表人的缺位，在部分国有控股和民营控股的上市公司中存在“一股独大”的问题，且相当一部分上市公司的董事长与总经理合二为一，“内部人控制”现象十分严重。在现行审计关系格局和现行注册会计师职业监管与制裁机制下，当注册会计师揭露客户的舞弊行为而要承担被解聘的风险时，就完全有可能为上市公司提供一切服务，屈从于上市公司，为其出具虚假的审计报告，甚至共同作弊。由此破坏了注册会计师审计的独立性，直接降低了审计的价值，给投资者的权益和资本市场的稳定，乃至注册会计师行业自身的发展都造成了严重的危害。
　　2、影响审计人员独立性的因素是：
　　从审计市场来看，客户掌握着审计人员的选择权，随着商品经济中人们对金钱价值的认可，部分审计人员在个人的经济利益面前受不住诱惑，放弃职业操守，使审计完全服从于企业的经营意识，丧失了其发表独立审计意见的职能。审计人员有限的工作能力也是影响审计独立性的一个重要因素。审计人员缺乏足够的职业素质，过分依赖被审计单位提供的内部控制的数据，缺乏必要的现代会计知识，欠缺综合分析能力和实际判断能力，执业经验有一定的限制，同时业务水平参差不齐，不能够高质量进行有力的审计工作。自然难以形成独立的审计意见。影响审计人员的独立性，也就影响了审计工作的独立性。
　　3、经济方面的原因是：
　　在我国由于会计事务所规模偏小，不仅正常的审计业务难以规划，而且小规模会计师事务所审计大公司，在经济上也不可避免地会对大客户产生依赖，致使其难以独立、客观、公正地发表审计意见，同时也致使一些事务所为争取审计业务，千方百计不顾职业道德，通过拉关系、找熟人等采用一些不正当的联络方式，使审计工作一开始就蒙上了一层灰色阴影，不按照注册会计师审计工作的职业道德去进行合法性、合规性、合理性的公平竞争，而是形成了一种本身就无法可言的竞争，这种恶性竞争动摇了整个审计工作的独立性，势必导致一个不规范的审计结果，同时也完全降低了审计信息的可信性。目前民间自律机制还难以在短期内形成，致使整个行业的独立性在一定程度上的缺失，这是一个亟待解决的问题。
　　4、法律监控方面的原因是：
　　制度供给明显滞后于现实需要，例如目前我国的《注册会计师法》和相关法律条例对注册会计师审计独立性的规定不够详尽，造成审计人员在审计过程中出现无法可依的现象。这是因为任何法律、法规和准则从制订、出台到实施都需要一定的程序和时间，再加上情况的多样性、隐蔽性和复杂性，管理者无法制订出面面俱到的法律、准则和条款来规范审计行为，这样就容易造成约束内容上的空白，难以及时持续地保持对审计独立性的支持。致使审计独立性得不到有效的监控，审计工作缺乏可信性。